33 Aplikasi Kimia di Linux Ubuntu dan Turunannya

Beberapa waktu yang lalu, dosen saya membuat distro linux yang dipaketkan dengan banyak aplikasi kimia. Namun ternyata untuk beberapa laptop teman spesifikasi minimalnya tidak terpenuhi, sehingga tidak dapat me-running distro linux tersebut. Kemudian saya melakukan resmastering dari Linux yang saya pakai (dengan DE yang lebih ringan), yang sebelumnya juga telah saya paketkan dengan banyak aplikasi kimia. Dan hasilnya dapat running di beberapa laptop teman saya tersebut.

image

Berikut ini adalah 33 aplikasi kimia yang saya paketkan.

1. Avogadro

avogadro

Avogadro merupakan molecular builder/editor yang bersifat bebas dan terbuka dibawah lisensi GNU GPL. Aplikasi ini tersedia dalam versi Windows, Mac OS X dan Linux.

2. Bkchem

bkchem

BKChem merupakan editor yang dapat digunakan untuk menggambar struktur kimia suatu molekul dan reaksi kimianya. Aplikasi ini dikembangkan oleh Beda Kosata dan diditribusikan dibawah lisensi GNU GPL. BKChem tersedia dalam versi Windows, Mac OS X dan Linux.

3. GChemCalc

chemical calculator

Aplikasi ini merupakan aplikasi kalkulator kimia sederhana. Aplikasi ini dapat menentukan rumus umum, massa molekul, komposisi massa dan isotopnya.

4. Chemtool

Chemtool

Chemtool merupakan aplikasi yang dapat digunakan untuk menggambar dan mengkalkulasi suatu struktur kimia.

5. Dozzaqueux

dozzaqueux

Dozzaqueux merupakan simulator untuk campuran kimia (chemical mixtures).

6. DRAWxtl

drawxtl

DRAWxtl merupakan aplikasi penampil struktur kristal.

7. EasyChem Chemical Structures Editor

EasyChem Chemical Structures Editor

EasyChem Chemical Structures Editor merupakan suatu molekul modeller yang dapat digunakan untuk membuat struktur kimia dengan kualitas tinggi.

8. G3Data Graph Analyzer

g3data

G3Data Graph Analyzer merupakan suatu program scanning untuk mendapatkan data dari gambar grafik.

9. Gabedit QC-GUI

gabedit

Gabedit QC-GUI merupakan suatu graphical user interface (GUI) dari paket aplikasi kimia komputasi FireFly, GAMESS-US, Gaussian, Molcas, Molpro, OpenMopac, Orca, MPQC, NWChem dan Q-Chem.

10. Gamgi

gamgi

Gamgi (General Atomistic Modelling Graphic Interface) merupakan aplikasi viewer, konstruksi, dan analisis struktur atom.

11. Garlic Protein Visualization

garlic

Garlic Protein Visualization merupakan aplikasi untuk memvisualisasi dan beberapa objek geometrik.

12. GaussSum

gausssum

GaussSum dapat mem-parsing file output dari perhitungan ADF, GAMESS, GAMESS-UK, Gaussian, Jaguar dan PC GAMESS untuk mendapatkan informasi.
GaussSum ditulis oleh Noel O'Boyle dan tersedia secara gratis di bawah lisensi GNU Public.

13. GchemPaint Chemical Structures Editor

GChemPaint Chemical Structures Editor

GchemPaint Chemical Structures Editor merupakan suatu editor untuk pemodelan molekul 2D.

14. GDIS Molecule Modeller

gdis

GDIS Molecule Modeller merupakan aplikasi modelling dan manipulasi molekul serta membuat rendering molekul dengan kualitas tinggi.

15. GDPC Molecular Dinamic Simulator

gdpc

GDPC Molecular Dinamic Simulator merupakan suatu simulator untuk memvisualisasi molekul dinamik.

16. Gnome Crystal Crystalline Structures Viewer

gnome crystal

Gnome Crystal merupakan aplikasi sederhana untuk visualisasi struktur kristal. Aplikasi ini menggunakan format file sendiri, dan dapat membuka file dalam format cif dan cml. File dari aplikasi Gnome Crystal juga dapat ditampilkan dalam laman html jika menggunakan Mozilla Firefox.

17. Gperiodic

gperiodic

Gperiodic merupakan This program shows the periodic table of elements and information about these elements

18. Grace

grace

Grace merupakan suatu tool WYSIWYG (what you see is what you get) untuk membuat plot dua dimensi dari data numerik.

19. Jmol

jmol

Jmol merupakan perangkat lunak bebas dan terbuka yang dikembangkan oleh Jmol Team. Jmol tersedia dalam versi Windows maupun Linux.

20. Kalzium

kalzium

Kalzium merupakan aplikasi periodik table berbasis KDE Development Platform.

21. massXpert

massxpert

22. mMass

mmass

mMass merupakan suatu viewer untuk spektrum massa dan tool untuk analisis data proteomics.

23. GChem3D Viewer

gchem3d

Gchem3D merupakan suatu aplikasi simpel untuk visualisasi struktur molekul.

24. Periodic Table

periodic table

Periodic Table merupakan suatu periodic table viewer dengan informasi yang detail untuk unsur-unsurnya.

25. Periodic table of the elements

periodic table of the elements

GChemTable merupakan aplikasi tabel periodik unsur-unsur kimia. Aplikasi ini menyediakan informasi saintifik dari unsur-unsur dan skema warna tabel.

26. PyMOL Molecular Graphics System

pymol

PyMOL Molecular Graphics System merupakan aplikasi modelling struktur molekul dan dapat menghasilkan gambar dengan kualitas tinggi.

27. RasMol

rasmol

RasMol merupakan aplikasi renderer molekul. Aplikasi ini dapat digunakan untuk menampilkan makromolekul dan menyiapkan kualitas gambar publikasi molekul.

28. ShelXle

shelxle

ShelXle merupakan sebuah tool untuk pemurnian molekul kecil SHELX. Aplikasi ini mengkombinasikan sebuah editor dan simple syntax highlighting dengan representasi OpenGL dari suatu struktur.

29. Gspectrum

gspectrum

Gspectrum merupakan aplikasi spectrum viewer. Aplikasi ini dapat memuat berbagai macam file dalam format JCAMP-DX. Aplikasi ini juga dapat memuat data NMR dari format NUTS. Spektrum yang support dengan aplikasi ini antara lain UV-Visible, IR, Raman, NMR (spektrum dan FIDs) dan spektrum massa.

30. ViewMol

viewmol

ViewMol merupakan aplikasi simple molecular viewer.

31. V_Sim

v_sim

V_Sim merupakan aplikasi untuk visualisasi atom.

32. XcrySDen

xcrysden

XcrySDen merupakan aplikasi visualisasi struktur molekul dan kristal. Aplikasi ini juga dapat digunakan untuk membuat animasi baik dalam format gambar gif maupun video mpeg/avi.

33. XmakeMol

xmakemol

XmakeMol merupakan aplikasi viewer dan manipulasi atom serta sistem kimia lain.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *